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想问一个RNA-Seq的流程问题
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想问一个RNA-Seq的流程问题
RNASeq数据处理
就是在用cufflink计算得到fpkm值后,得到的gene.fpkm-tracking文件接下来需要做什么操作或者工具处理?是用cuffdiff得到差异基因的diff文件吗还是其他什么?看live和视频里是到了cufflink这一步都弄懂了,但是cuffdiff和最后的RNA-Seq分析结果文件是什么还有点懵,请教大家啦
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孟浩巍
超级管理员
用户来自于: 北京市
2018-09-10 20:00
如果你只是想做差异表达gene分析,那么可以不用cufflink,直接用cuffdiff计算就好,你的input文件包括gtf文件和比对好的BAM文件,输出就是gene的差异统计结果。 也就是咱们视频里面的内容。
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General浩曦
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这家伙很懒,还没有设置简介
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发布时间
2018-09-10 19:41
更新时间
2018-09-10 20:00
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