bowtie2使用报错，求助啦 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

3: 关注

2028: 浏览

bowtie2使用报错，求助啦

问题求解

使用如下代码：bowtie2 -p 4 -x hg19_bowtie2/hg19 -1 C2_R1_git2_reads_1.fastq.gz -2 C2_R2_git2_reads_2.fastq.gz -S C2.sam 出现下图报错：

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 3 个回答

海王坑前台管理员用户来自于: 北京市海淀区
2018-09-08 11:27

使用Bowtie2进行序列的比对，首先是要使用bowtie2-bulid生成参考序列的索引数据库，你的电脑在建库的时候内存不足，考虑换一台内存大的电脑或者用服务器去比对？

赞同 1 0评论

关于作者

: windowft 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

2: 回答

0: 文章

4: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-08 11:00

更新时间: 2018-09-09 22:07

关注人数: 3 人关注

相关问题

我的Rstudio所有的函数都是出现报错说没有某某某函数: 2219 浏览 5 关注 4 回答 0 评论

虚拟机中使用GEC进行GWAS阈值矫正: 1985 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

【求助】怎么能画出子网络图: 1025 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

20170804高通量测序视频中05 mapping.sh报错问题: 1651 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

tophat报错 & cufflinks安装报错: 1433 浏览 2 关注 0 回答 0 评论

Liux中gtftk closest_genes怎么使用？: 1529 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

Bowtie2使用中遇到的内存不足问题: 2041 浏览 1 关注 2 回答 0 评论

sudo apt-get install gcc++出现如下报错该如何解决？系统是：ubuntu14 server 版: 1404 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

ChIPseeker 报错: 1369 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

使用cutadapt去掉adaptor后，fastqc结果的sequence distribution报错: 2109 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问画heatmap出现错误提示: 1205 浏览 2 关注 1 回答 1 评论

问如何快速将基因名称转换为基因ID(拟南芥）: 1804 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问科研/读博: 2037 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 linux系统中使用fastqc报错: 2752 浏览 3 关注 3 回答 0 评论

问使用cutadapt去掉adaptor后，fastqc结果的sequence distribution报错: 2109 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 R进行GO时出现No gene can be mapped....: 1968 浏览 3 关注 3 回答 0 评论

问分析CRISPR 高通量筛选数据: 2063 浏览 1 关注 2 回答 0 评论

问用R画RNA_seq中变化显著的heatmap聚类热图: 2194 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

问利用GATK的HaplotypeCaller生成GVCF一直报错怎么回事: 2267 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问如何处理fastqc报告中duplication level报错的问题: 2800 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025