使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。初始数据命名为pbmc

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一般报告基因组某个碱基突变是指正链还是负链

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耐药细菌的比较基因组分析流程和机制探索

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基因表达

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在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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用log2(fold_change)数据做热图，遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时，怎么办？

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WGCNA筛选到感兴趣的模块后，如何找这个模块的hub基因呢？

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关于基因间的相关性分析

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根据GFF和fasta等文件提取某一基因的ATG位点信息，比如具体的位置？

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先埋一个帖子，希望一年之后大家都能收获到自己想要的。

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问 关于基因间的相关性分析

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问 关于蛋白质文件的疑问

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问 去除批次效应选定靶标细胞群后如何进行亚群分析？

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问 关于cox回归分析问题

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问 根据已知序列查找其第三代基因组编号

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问 annovar建立非模式物种注释库后怎么分析

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问 如何筛选小鼠lncRNA?

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问 riboseq中frame指的是什么，是如何确定的，通过riboseq如何知道一个基因的开放阅读框

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问 sambamba使用

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问 基因本体论分析上下调基因差异

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