使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。出现问题

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在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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如何理解单细胞测序中用fastQC对低质量细胞进行过滤

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log2(fold_change)可以用来做热图吗？遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时，怎么办？

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参考基因组添加外源基因序列进行比对

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使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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annotatePeak peak基因组注释

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基因symbol注释GEO芯片时，如何把mRNA和lncRNA分别标注出来？

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常用的对测序序列进行聚类分析的软件有什么？及其使用的了什么算法？

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