芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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基因组组装问题

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宏基因组进行binning分析

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菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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信号通路特征基因集的查询？用于作ssGSEA分析。

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IOBR包输入基因表达矩阵要求

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验证数据集基因名称

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WGCNA筛选到感兴趣的模块后，如何找这个模块的hub基因呢？

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如何在差异表达前消除批次效应

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细菌基因组分析

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问 链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？

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问 转录组测序问题

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问 请问hisat2+stringtie+deseq2的标准流程

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问 HISAT2建立索引

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问 log2(fold_change)可以用来做热图吗？遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时，怎么办？

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问 菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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问 聚类数据标准化

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问 如何根据转录组数据得到新转录本？如何验证一个基因的多个转录本？

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问 原核生物的转录组测序为什么比真核的贵？

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问 请教一个问题，一个转录因子TF只会调控位于同一条链的基因，还是有可能调控反义链的基因？

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