该问题已被锁定!
2
关注
1668
浏览

RNA Seq中什么样的reads是chimeric reads?是不是多数的chimeric reads都是circRNA的?

为什么被折叠? 0 个回复被折叠
孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2018-09-05 13:11
因为测序的时候是Read1和Read2是头对头,切分布在2条链上,所以在正常mapping回去的时候也应该是Read1和Read2是头对头,切分布在2条链上。   但是如果是circRNA被测序到,这个测序就会出问题,就会出现本来应该出现两种朝向完全相反的情况,当出现这种情况的时候,就是你要的circRNA序列。    

问题动态

发布时间
2018-09-05 12:49
更新时间
2018-09-05 13:11
关注人数
2 人关注

相关问题

Bulk-RNAseq多组数据差异表达基因的筛选
chip-seq数据下载有多个SRA
smart-seq2样本质检报告说有小片段,请问那还可以建库么?
如何获得cas9蛋白的高效低效的sgRNA
使用cutadapt去掉adaptor后,fastqc结果的sequence distribution报错
请教多个scRNA样本整合问题
Chip-seq bam文件的处理
含有2个重复的Chip-seq的bw文件的展示
tsRNA测序思路求助
【坐标北京】近期准备做一些RNA-seq,想请问一下大家哪些公司比较靠谱?-w-

推荐内容

L1插入位点的百分比密度分布
使用tophat2和bowtie1寻找环形RNA时报错
染色体号是罗马数字怎么写sh循环
HHblits使用相同的数据库,得出的结果明显差于HHpred网页版的结果。该如何使用HHsuite命令行得到与网页端类似的效果
logistic回归、异常值
bcl2fastq2安装问题
atac重复样品可视化
bulk-RNAseq数据集整合
how to speed up following code 
转录本坐标转换成基因组坐标
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025