该问题已被锁定!
2
关注
2199
浏览

RNA Seq中什么样的reads是chimeric reads?是不是多数的chimeric reads都是circRNA的?

为什么被折叠? 0 个回复被折叠
孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2018-09-05 13:11
因为测序的时候是Read1和Read2是头对头,切分布在2条链上,所以在正常mapping回去的时候也应该是Read1和Read2是头对头,切分布在2条链上。   但是如果是circRNA被测序到,这个测序就会出问题,就会出现本来应该出现两种朝向完全相反的情况,当出现这种情况的时候,就是你要的circRNA序列。    

问题动态

发布时间
2018-09-05 12:49
更新时间
2018-09-05 13:11
关注人数
2 人关注

相关问题

RNA-seq reads和表达量在转座子上的分布meta图
bulk-RNAseq数据集整合
ciriRNA表达量如何计算?(更)
RNA-seq差异分析
基因symbol注释GEO芯片时,如何把mRNA和lncRNA分别标注出来?
chip-seq数据下载有多个SRA
ChIP-seq测序深度
求助,安装DESeq2遇到问题
含有2个重复的Chip-seq的bw文件的展示
网上下载的DNA sequence 为什么前面和后面有一段N是什么意思?

推荐内容

使用bedtools提取序列时的deyond length问题;bed负值
SPSS报错
linux下使用convert出现报错,可能是什么原因?如何解决?
关于基因间的相关性分析
转录本坐标转换成基因组坐标
不同样品中寻找特异的OTU
如何按一个列表对基因型文件进行过滤,剔除不需要的样本?
链特异性文库(mRNA/lncRNA/circRNA)如何将RNA类型分开?
使用lapa进行APA分析
3D基因组里,如何分清compartment、TAD和chromatin loop
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025