RNA Seq中什么样的reads是chimeric reads？是不是多数的chimeric reads都是circRNA的？ - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

2510: 浏览

RNA Seq中什么样的reads是chimeric reads？是不是多数的chimeric reads都是circRNA的？

生信问题

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-05 13:11

因为测序的时候是Read1和Read2是头对头，切分布在2条链上，所以在正常mapping回去的时候也应该是Read1和Read2是头对头，切分布在2条链上。但是如果是circRNA被测序到，这个测序就会出问题，就会出现本来应该出现两种朝向完全相反的情况，当出现这种情况的时候，就是你要的circRNA序列。

赞同 0 0评论

问题动态

发布时间: 2018-09-05 12:49

更新时间: 2018-09-05 13:11

关注人数: 2 人关注

相关问题

riboseq中frame指的是什么，是如何确定的，通过riboseq如何知道一个基因的开放阅读框: 2661 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

请问RNA-seq采用poly A(+)策略建库，处理数据时若不去除rRNA会对后续分析有何影响？: 2432 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

seqtk的使用技巧，可以处理那些序列问题？: 2356 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

ATAC-seq样本重复数: 2801 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

reads数越多，滑窗内GC含量降低: 2474 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何筛选小鼠lncRNA?: 2421 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何获得cas9蛋白的高效低效的sgRNA: 2371 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

最新的cas9蛋白的sgRNA的数据集: 2402 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

deeptools对ChIP-seq可视化中bw文件的选择问题？: 2680 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

ciriRNA表达量如何计算？（更）: 2617 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问如何根据Datamonkey中FUBAR的结果计算该基因的dn/ds值: 4248 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 sc-ATAC数据质控: 3079 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问请问cytoscape是怎么构建网络的？: 2225 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

问关于ceRNA网络构建的后续分析有哪些？: 2200 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问请问下这种格式的R语言内容如何选择最小值: 2689 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 Ancestry_hmm: 1616 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

问 linux下使用convert出现报错，可能是什么原因？如何解决？: 3217 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 how to speed up following code: 2423 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2026