张建鹏 初级会员

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张建鹏 在 2023-05-31 16:36 回答了问题
blast
已经有不同材料的全基因组二代测序数据，查找是否存在某个已知基因？
张建鹏: 你可以先将二代数据比对到参考基因组上，将比对到已知基因上的reads提取出来，使用二代组装软件从头组装；或者首先从头组装不同水稻材料S1 S2 S3，获得contigs，然后使用已知基因的序列去blast组装的contigs
张建鹏 在 2018-09-07 17:50 回答了问题
数据库使用
通过SRA编号寻找对应的文章
张建鹏: 到NCBI搜一下SRA编号，点进任意搜索结果，然后你找到PRJN开头的研究项目编号，点击就会出现你要的东西  
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