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Pancras 在 2018-10-08 17:34 发起了提问
无参转录组
问答 在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下，如何利用cuffdiff进行差异基因分析。
辅导辅导员的辅导员: 我只是过来水一下，cuffdiff首先要输入gtf文件，所以可以先搞定一个gtf，可不可以先用tophat你拼接的参考转录本，然后用cufflinks拼接，然后cuffmerge，得到gtf，然后就可以做cuffdiff了？我不太懂，只是水一下，欢迎指出我的不当之处  
Pancras 在 2018-09-25 14:46 发起了提问
转录组差异基因表达分析
问答 如何利用利用TPM或者FPKM完成DESeq2完成的工作?
孟浩巍: DESeq2 是针对count设计的，TPM和FPKM不适合它。
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