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辅导辅导员的辅导员在 2018-10-08 18:37 回答了问题 无参转录组: 在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下，如何利用cuffdiff进行差异基因分析。; 辅导辅导员的辅导员: 我只是过来水一下，cuffdiff首先要输入gtf文件，所以可以先搞定一个gtf，可不可以先用tophat你拼接的参考转录本，然后用cufflinks拼接，然后cuffmerge，得到gtf，然后就可以做cuffdiff了？我不太懂，只是水一下，欢迎指出我的不当之处; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 3 回复

辅导辅导员的辅导员在 2018-10-01 09:03 发起了提问 参考基因组: 问答基因组文件中chrUn具体是什么意思呢

我用的是小麦基因组IWGSC1.0，chrUn我理解应该是序列已知但是锚定不到染色体的序列，但是chrUn这个文件400m，是一条非常完整的染色体序列,我就非常奇怪了，按道理unkonwn不是应该一段一段的吗？:; 关注问题 0  0  1 评论

辅导辅导员的辅导员在 2018-10-01 08:21 回答了问题 截取基因片段: 关于截取某基因前后200bp片段; 辅导辅导员的辅导员: 坑主回答真是详细; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

辅导辅导员的辅导员在 2018-10-01 08:20 回答了问题 R语言: 如何一个数据表中第一列都统一删除三个字母保留数字再输出为一个新表; 辅导辅导员的辅导员: 用python的话是如果前三个字母在前面的话就是 f1=open(文件) f1=open(写出文件，‘w’) for line in open ****： line=line[3:] f2.write（line）; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

辅导辅导员的辅导员在 2018-09-29 10:04 回答了问题 染色体: 想画一个染色体类似于条形码的图，大家有什么建议; 辅导辅导员的辅导员: [attach]275[/attach]; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

辅导辅导员的辅导员在 2018-09-29 10:03 发起了提问 染色体: 问答想画一个染色体类似于条形码的图，大家有什么建议

辅导辅导员的辅导员: [attach]275[/attach]; 关注问题 2  4  0 评论

辅导辅导员的辅导员在 2018-09-23 10:45 发起了提问 无参转录组: 问答无参基因组分析GO富集到了这一步不会做

我筛选完差异基因列表，然后也得到转录本对应的GO号如下但是下一步应该是整理这些GO号，大家都用clusterprofile但是我看了mannual发现用的ID要求的embl，所以。。下一步怎么整理求帮助 [attach]257[/attach] :; 关注问题 1  0  0 评论

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