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刘正 发起了提问 2023-05-17 18:25 保守蛋白: 问答如何在20个蛋白序列里找3个motif

如何在20个蛋白序列里找3个motif:; 关注问题 2  0  0 评论

Kevin_Lyu 回复了问题 2018-10-03 16:37 生信具体问题: 问答蛋白保守序列分析

Kevin_Lyu: TBtools应该可以满足你的需求，作者也有写一个基因家族分析的教程：https://mp.weixin.qq.com/s/-ZEQ7_2i4ozUjpVDmMfkAg; 赞同1 反对 0 人感谢 1 评论 1 回复

Czc 回复了问题 2018-10-03 14:02 数据库: 问答 SRA、SRP、SRX、RUN等一些列NCBI genebank数据库中的一些缩略词官方解释或者全称，谢谢，虽然做了一段时间生信但是对这些小问题并没有重视，希望大家解答

Czc: 233333，，好像自己在生信技能树上找到了答案 [url]http://www.biotrainee.com/thread-800-1-2.html[/url] [size=14]跟GEO类似.[/size] [size=14]NCBI的SRA（Sequence ReadArchive）数据库是抓...; 赞同1 反对 0 人感谢 1 评论 1 回复

Czc 回复了问题 2018-10-03 09:28 差异基因 RNA_seq: 问答 RNA-seq不同样本多个生物学重复不同处理条件下的如何找差异基因

Czc: 我同意楼上的说法，主要是看你想要什么样的结果，如果你是想要看treatment和non-treatment之间的不同就分三组做，你要是想看WT、OE-1、OE-2的就可以单独的拿这三组数据做，你要是想要看整体的，就很难计算了，我曾经做过四组之间的不同的差异表达分析，我当初的想法是这样的，就是A与B比...; 赞同2 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

stallworth 回复了问题 2018-10-02 15:32 生物信息学 生信入门 如何入坑: 问答生信到底如何入门？？？

stallworth: 进了实验室逼自己一把就入门了; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 6 回复

Holly 发起了提问 2018-10-01 18:22 NETWORK4.6: 问答 NETWORK4.6

有结果文件，怎么通过这个软件改各个基因的名字:; 关注问题 1  0  0 评论

海王坑 回复了问题 2018-10-01 12:36 R语言: 问答如何一个数据表中第一列都统一删除三个字母保留数字再输出为一个新表

海王坑: R语言：用gsub()函数; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

辅导辅导员的辅导员 发起了提问 2023-05-17 18:05 参考基因组: 问答基因组文件中chrUn具体是什么意思呢

我用的是小麦基因组IWGSC1.0，chrUn我理解应该是序列已知但是锚定不到染色体的序列，但是chrUn这个文件400m，是一条非常完整的染色体序列,我就非常奇怪了，按道理unkonwn不是应该一段一段的吗？:; 关注问题 0  0  1 评论

辅导辅导员的辅导员 回复了问题 2018-10-01 08:21 截取基因片段: 问答关于截取某基因前后200bp片段

辅导辅导员的辅导员: 坑主回答真是详细; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

Emile 回复了问题 2018-10-01 06:51 python文件处理: 问答 python怎么追加输出一列

Emile: 原生代码可以用双重循环构造二维列表，numpy包有转置函数T以及多种行列合并函数，pandas包可以像R一样添加列（ex. df[column_name] = result_list），最后再统一输出到文件。行和列只是只是定义问题，对于这种结构化的数据，都可以把原来的列变量视为行变量，然后利用转...; 赞同2 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

YIMUAXU 发起了提问 2018-09-30 20:39 多样性分析: 问答 R软件里Bray-Curtis指数计算

求一个在R里计算的代码:; 关注问题 1  0  0 评论

吴硕 回复了问题 2018-09-30 19:53 mRNA和lncRNA 芯片注释: 问答基因symbol注释GEO芯片时，如何把mRNA和lncRNA分别标注出来？

吴硕: [size=14]GPL570平台[/size]; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

minipeach 发起了提问 2023-05-17 18:25 生信入门: 问答关于hub基因的问题

请问hub基因一般是哪些基因？比如是mRNA还是lnc或者miRNA?:; 关注问题 2  0  0 评论

minipeach 发起了提问 2018-09-30 13:32 生信入门 生信问题 生信分析: 问答关于生存分析的问题

[attach]289[/attach] 我想知道这样的表格是怎么制作的，展示的这张是一篇文献中的表，他是自己提取TCGA的clinical中的信息做的还是有其他的什么软件或者包之类的？:; 关注问题 1  0  0 评论

孟浩巍 回复了问题 2018-09-30 10:45 生物信息学 生信问题: 问答关于GO分析的问题

孟浩巍: 可以，但是有可能注释不全。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

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