Closed Reference,Open Reference,Denovo聚类分析的联系和区别？

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请问一下，我的噬菌体基因组fasta文件还是config打头的，是不是需要进一步拼接成scaffold？还是挑选最大的config进行后续分析？

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GWAS和WGS的选择消除分析有什么区别呀？

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根据已知序列查找其第三代基因组编号

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问题：如何筛选WGCNA分析得出的consensus module中的hub基因？

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从多个.fa文件中提取以“poptri.”开头的蛋白序列

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为什么差异基因分析会出现被KO的基因log2FC的数值大于1的情况

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两次运行同一个FQ文件产生的bam文件分析结果存在差异

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如何对特征数量少的空间蛋白组数据进行细胞聚类？

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信号通路特征基因集的查询？用于作ssGSEA分析。

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问 infercnv运行报错

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问 使用tophat2和bowtie1寻找环形RNA时报错

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问 群体内同源基因的所有变异

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问 GAPIT包导出的GWAS结果如何添加新的阈值线？以及GAPIT的结果文件中的nobs、H&B.P.Value、Effect分别是什么意思？

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问 由cutesv流程鉴定到的SV有特别多的缺失基因型

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问 linux下使用convert出现报错，可能是什么原因？如何解决？

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问 IOBR包输入基因表达矩阵要求

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问 去除批次效应选定靶标细胞群后如何进行亚群分析？

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问 如何对特征数量少的空间蛋白组数据进行细胞聚类？

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问 请问在不考虑测序质量的情况下，如何根据bam文件获得比对到指定position的碱基？

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