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综合问题文章简介

chatGPT机器人 回复了问题 2023-05-28 15:48 生信入门: 问答备份

chatGPT机器人: 备份服务器上的数据是非常重要的，特别是对于生物学家和生物信息学家来说，因为这些数据可能是他们的研究成果或者是宝贵的实验数据。以下是备份服务器数据的一些方法： 1. 定期备份数据定期备份是保护数据的最佳方法之一。生物学家和生物信息学家应该至少每天备份一次数据，以确保数据的安全性。此外，备份数据的频...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

孟浩巍 回复了问题 2023-05-26 16:35 生信入门: 问答如何从NCBI上分别下载所有的RNA病毒和DNA病毒的序列

孟浩巍: 你是想下载NT库和NR库里的病毒序列吗？直接去NCBI的FTP站上，都可以直接下载。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

chatGPT机器人 回复了问题 2023-05-26 00:20 生信入门: 问答怎么对基因启动子含有什么元件进行分析

chatGPT机器人: 对于基因启动子元件的分析，可以通过生物信息学方法进行研究。以下是一些可能的分析方法： 1.序列比对：对于已知的基因启动子序列，可以进行多序列比对，找出共同的序列片段，这些片段可能是一些重要的元件，如转录因子结合位点（TFBSs）等。 2.转录因子预测：通过生物信息学工具，可以预测哪些转录因子可能...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人 回复了问题 2023-05-23 15:19 生信入门: 问答选择信号检测XP-CLR

chatGPT机器人: 首先，我们需要了解XP-CLR的计算方法。XP-CLR方法通过分析两个群体间的连锁位点等位基因频率差异来检测选择扫描（selective sweep）。XP-CLR得分表示两个群体间某个位点的选择压力大小，得分越高表示该位点受到的选择压力越大。在该文章中，使用了20 kb大小、2 kb步长的滑动窗...; 赞同0 反对 0 人感谢 1 评论 1 回复

孟浩巍 回复了问题 2023-05-23 15:15 生信入门: 问答老孟你今答题效率逆天啊，连续几个都是你在答～

孟浩巍: 哈哈，效率要高！; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

chatGPT机器人 回复了问题 2023-05-17 13:06 生信入门 生信分析 生信问题 转录组比对 转录组: 问答链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？

chatGPT机器人: 在处理去除核糖体的链特异性文库时，可以使用不同的分析方法来区分不同类型的RNA： mRNA：由于mRNA具有5'端帽子和3'端聚腺苷酸尾巴，因此可以使用帽子捕获和尾部寡聚体选择的方法来富集mRNA。 lncRNA：lncRNA的长度通常大于200nt，而mRNA的长度通常在1000nt以下...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

孟浩巍 回复了问题 2018-10-12 17:26 生信入门 生物信息学: 问答生信问题（我也不知道该怎么问）

孟浩巍: TCGA的样本数据可以下载下来，里面包含了年龄性别什么的，然后这个是自己整理的。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

admy 回复了问题 2018-10-11 11:12 生信入门: 问答网页database

admy: [b]送你两个最干最干的干货：[/b] [list] [*][url]http://www.w3school.com.cn/[/url][/*] [/list] [list] [*][url]https://www.freecodecamp.org/[/url][/*] [/list] ...; 赞同2 反对 0 人感谢 1 评论 1 回复

elementoK 发起了提问 2018-10-10 11:43 生信入门: 问答 tophat报错 & cufflinks安装报错

tophat运行指令如下： [code]nohup tophat2 -p 10 -o ~/desktop/tophat_result/model ~/desktop/mm10/mm10_index ~/desktop/cleandata/mmhcRNA-model.read1_Clean.fastq...:; 关注问题 2  0  0 评论

stallworth 回复了问题 2018-10-02 15:32 生物信息学 生信入门 如何入坑: 问答生信到底如何入门？？？

stallworth: 进了实验室逼自己一把就入门了; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 6 回复

minipeach 发起了提问 2023-05-17 18:25 生信入门: 问答关于hub基因的问题

请问hub基因一般是哪些基因？比如是mRNA还是lnc或者miRNA?:; 关注问题 2  0  0 评论

minipeach 发起了提问 2018-09-30 13:32 生信入门 生信问题 生信分析: 问答关于生存分析的问题

[attach]289[/attach] 我想知道这样的表格是怎么制作的，展示的这张是一篇文献中的表，他是自己提取TCGA的clinical中的信息做的还是有其他的什么软件或者包之类的？:; 关注问题 1  0  0 评论

笨阿牛 回复了问题 2018-09-28 09:53 生信入门: 问答想补充生信统计学知识

笨阿牛: 这个问题太好了; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍 回复了问题 2018-09-24 16:14 测序原理 生信入门: 问答新人求教关于测序以及免疫的问题

孟浩巍: 简单来说吧，genome绝大多数的区域是非gene区，gene的绝大多数是intron，少数是exon（外显子）。而对于一些疾病来说，绝大多数情况下是exon的突变造成的。因此对于这种情况下，如果进行全genome的测序，就会浪费很多测序量，很多时候只测exon就行了，这就是外显子组测序的优势...; 赞同2 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

minipeach 回复了问题 2018-09-19 20:38 生信入门 生信分析 生物信息学 生信问题: 问答关于基因间的相关性分析

minipeach: [attach]245[/attach] 这样的两个基因算相关性强吗？; 赞同0 反对 0 人感谢 2 评论 2 回复

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