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elementoK 在 2018-10-10 11:43 发起了提问
生信入门
问答 tophat报错 & cufflinks安装报错
tophat运行指令如下： [code]nohup tophat2 -p 10 -o ~/desktop/tophat_result/model ~/desktop/mm10/mm10_index ~/desktop/cleandata/mmhcRNA-model.read1_Clean.fastq...:
elementoK 在 2018-08-29 16:24 发起了提问
生信分析
问答 关于RSEM和RPKM
孟浩巍: 癌症的数据尤其是TCGA的数据现在都是给RSEM，大家目前测序常用的还是FPKM，RPKM，TPM。   个人观点是RSEM的缺点在于不直观，优点是通过机器学习的办法处理了一些因素，而不是像FPKM，RPKM，TPM这些，线性处理所有的情况。   我个人的观点是，癌症数据大家现在都用RSEM，那么我...
elementoK 在 2018-08-28 21:58 发起了提问
Gene ID转换
问答 关于gene id转换以及“org.Hs.eg.db"包（小剧场？）
孟浩巍: 你现在的问题是其实是因为你的gene id前面两个字符导致的问题，假设你的table的名称为input_table,   [code]# gene real gene id gene_id.fix = substr(input_table$gene_id,3,nchar(input_table$g...
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