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笨阿牛在 2023-06-06 17:58 回答了问题 单细胞RNA_seq: 单细胞分析中在umap聚类（seurat, scanpy)有调整群位置的参数吗？; 笨阿牛: 可以修改你的UMAP坐标，其实就是XY轴的信息，调整到你满意。带着这个坐标做velocity分析，即可。可能有点造假，但是我称为半监督聚类，嘿嘿。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 3 回复

笨阿牛在 2018-10-12 19:22 发起了提问 CDS序列的批量下载: 问答请问一下，如何根据基因名批量下载CDS区的序列？

孟浩巍: 这个问题其实用UCSC genome browser里面的table browser 工具能够非常方便地解决。 [b]第1步，打开 UCSC genome browser里面的table browser；[/b] [url=https://genome.ucsc.edu/]https://gen...; 关注问题 2  1  0 评论

笨阿牛在 2018-10-05 22:28 回答了问题 算法: 在N-W算法中，为什么忽略了从x状态道y状态的转化（xi对应到一个空位到yi对应一个空位的转化）; 笨阿牛: 试着回答一下吧！首先说一下结论：我觉得高歌老师关于MXY状态的定义可能有一些小问题。高歌老师定义的状态如下图： [attach]290[/attach] 而所给的状态转移示例如下图： [attach]291[/attach] 这里面没有X→Y的转换。按照高老师的讲解：X→Y的例子为： A-...; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

笨阿牛在 2018-09-28 16:27 发起了提问 shell脚本学习: 问答编写shell脚本的if循环如下，结果运行的时候出现如下报错？原因是什么？大家学习shell变程的时候推荐哪些视频教程呢

pagu: shell里边的if控制结构，条件是用中括号 [ ] 框起来的，我改了一下可以运行： [code]num1=100 num2=200 if [ ${num1} > ${num2} ] then echo "this ${num1} is great!" else echo "thi...; 关注问题 2  1  0 评论

笨阿牛在 2018-09-28 09:53 回答了问题 生信入门: 想补充生信统计学知识; 笨阿牛: 这个问题太好了; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

笨阿牛在 2018-09-27 17:10 回答了问题 conda 安装deeptools conda: 请问一下，使用conda install deeptools之后，出现如下报错，如何解决呢？; 笨阿牛: 自问自答吧！ [size=14]conda clean --packages[/size] [size=14]输入上面的命令之后，再安装，居然就好了！完全摸不着头脑[/size]; 赞同1 反对 0 人感谢 2 评论 1 回复

笨阿牛在 2018-09-27 16:45 发起了提问 conda 安装deeptools conda: 问答请问一下，使用conda install deeptools之后，出现如下报错，如何解决呢？

笨阿牛: 自问自答吧！ [size=14]conda clean --packages[/size] [size=14]输入上面的命令之后，再安装，居然就好了！完全摸不着头脑[/size]; 关注问题 1  1  0 评论

笨阿牛在 2018-09-22 16:20 发起了提问 linux 静态ip设置: 问答请问一下，如何将登陆服务器局域网的ip设置为静态的呢？

孟浩巍: 这个需要去设置你的ip地址： 1. 首先切换到目录 [code]cd /etc/sysconfig/network-scripts[/code]2. 查看里面的内容，这里面存着每个网卡对应的配置文件，比如你有两个网卡，你就有会两个文件名类似ifcfg-em1, ifcfg-em2的文件，找到你对...; 关注问题 2  2  0 评论

笨阿牛在 2018-09-21 16:12 发起了提问 linux下gcc+安装问题: 问答 sudo apt-get install gcc++出现如下报错该如何解决？系统是：ubuntu14 server 版

孟浩巍: 我看你这个问题好久了，我帮你搜了搜。结果应该是几个包的版本冲突了，得一个一个卸载然后重新安装，如果特别麻烦你就重装系统吧…… 笑哭; 关注问题 2  0  0 评论

笨阿牛在 2018-09-18 10:01 发起了提问 sra文件解压缩: 问答双端测序的sra文件，经过fastq-dump --split-3，出现3个结果是什么原因？如下图

孟浩巍: 可能是提交数据的时候，单端和双端测序的数据混在一起了。建议后续分析的时候可以只用双端。; 关注问题 2  1  0 评论

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