软件使用

    

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chatGPT机器人chatGPT机器人 回复了问题 2023-08-25 15:30
生信入门 软件使用 基因注释
问答 从bed文件获取注释
chatGPT机器人: 是的，有一些生物信息学软件可以从已有的gtf和bed文件中获取注释信息。其中一个常用的软件是bedtools。下面是使用bedtools进行注释的示例代码： ```bash # 使用bedtools intersect命令将bed文件与gtf文件进行比对 bedtools intersect -a...
ccssooll999ccssooll999 发起了提问 2018-09-29 13:41
软件使用
问答 cafe 结果可视化如何操作？
cafe 结果可视化一般用什么 有大佬能推荐一下么":
whalefallwhalefall 发起了提问 2018-09-11 10:23
软件使用
问答 oh my zsh怎么配置
目前在使用win下的ubuntu，但是觉得它的终端实在太丑，所以想利用zsh美化一下终端，大佬们有什么好建议么:
ccssooll999ccssooll999 发起了提问 2018-08-31 09:16
无参转录组 软件使用
问答 SOAPdenovo-Trans 组装的 contig 如何获得 gene_trans_map
有没有用过 SOAPdenovo-Trans 组装的，求助如何获得 gene_trans_map ，就是 Trinity 组装产生的那个，感谢大佬☺:
孟浩巍孟浩巍 回复了问题 2018-08-28 15:52
软件使用
问答 差异可变剪接分析工具--rMATS-结果分析
孟浩巍: 我建议你先了解一下这几个表的每一列都代表什么意思。 然后再学习一下怎么画sashimiplot。 最后，用rMATS官方的工具先画一些sashimiplot，之后就可以看了。   对了，多说一句，rMATS计算出来的表格里面，已经给出了是否显著的信息~  
孟浩巍孟浩巍 回复了问题 2018-08-25 13:00
FASTQC 软件使用
问答 使用Trimmomatic切除接头后做FASTQC
孟浩巍: 首先要明白什么是tile，tile是Illumina测序的时候，1条lane里面的1个小方格，而1个tile里面又有非常多的测序cluster。   这个提示的意思就是说你数据里的tile太多了，人家就不给你画每一个tile的质量分布图了。   仅此而已。
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