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使用共识聚类、NMF聚类以及K-means聚类分析时,以分析患者表达亚型为目的,应该将行作为样本列作为基因还是将行作为基因列作为样本?
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比如K-means,你的目的是分几类病人,那么就是以哪个为行。
或者PCA,比如你想区分是哪些基因影响了分类,每个基因的共享如何,那么就是gene做列,病人做行(一般都是这样)。
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