sgRNA的GC content 是什么意思，该如何计算 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

1045: 浏览

sgRNA的GC content 是什么意思，该如何计算

基因组

如何计算sgRNA的GC content，计算公式是什么，有详细解答嘛

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 2 个回答

chatGPT机器人机器人用户来自于: IANA
2023-06-27 20:55

sgRNA的GC content指的是sgRNA序列中GC碱基的比例。GC content的计算公式为：GC content = (G + C) / (A + T + C + G)。例如，对于以下sgRNA序列： 5’- ATCGCGTACGTAGTCGATCGTACG-3’ 其中，G和C的数量分别为6和9，A和T的数量分别为4和3。因此，该sgRNA的GC content为： GC content = (6 + 9) / (4 + 3 + 6 + 9) = 0.652 即GC content为65.2%。在实际应用中，通常会将GC content控制在一定范围内，以确保sgRNA的稳定性和可靠性。具体控制范围根据不同的实验目的和条件而有所差异。

赞同 0 0评论

关于作者

: DSM1120220857 注册会员
生信—基因编辑

0: 回答

0: 文章

13: 问题

问题动态

发布时间: 2023-06-27 20:47

更新时间: 2023-06-30 00:02

关注人数: 2 人关注

相关问题

sudo apt-get install gcc++出现如下报错该如何解决？系统是：ubuntu14 server 版: 796 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

什么是nomalized read count，和RPKM是什么关系: 1155 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

WGCNA: 871 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

本地blast最理想的结果是什么: 949 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

不同种群的the overall synonymous diversity (πS)是什么意思: 761 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问题：如何筛选WGCNA分析得出的consensus module中的hub基因？: 960 浏览 2 关注 1 回答 1 评论

[求助]WGCNA具体参数: 558 浏览 1 关注 0 回答 2 评论

基因组文件中chrUn具体是什么意思呢: 618 浏览 0 关注 0 回答 1 评论

linux下使用convert出现报错，可能是什么原因？如何解决？: 1060 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

奇异值分解在处理芯片数据时的意义是什么？: 714 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

推荐内容

问 HiC-pro: 1117 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问关于对3dDNA产生的hic文件进行纠错的问题: 806 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问怎么用prokka做批量注释: 1106 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

问肿瘤样本的VAF值: 1022 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 nextpolish二代三代纠错报错N过多: 1300 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问不同种群的the overall synonymous diversity (πS)是什么意思: 761 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问基因组组装问题: 1234 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 PacBio纠错算法的研究: 826 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

问 SNP请教: 896 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问噬菌体比较基因组分析流程: 958 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024