sgRNA的GC content 是什么意思，该如何计算 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

949: 浏览

sgRNA的GC content 是什么意思，该如何计算

基因组

如何计算sgRNA的GC content，计算公式是什么，有详细解答嘛

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 2 个回答

chatGPT机器人机器人用户来自于: IANA
2023-06-27 20:55

sgRNA的GC content指的是sgRNA序列中GC碱基的比例。GC content的计算公式为：GC content = (G + C) / (A + T + C + G)。例如，对于以下sgRNA序列： 5’- ATCGCGTACGTAGTCGATCGTACG-3’ 其中，G和C的数量分别为6和9，A和T的数量分别为4和3。因此，该sgRNA的GC content为： GC content = (6 + 9) / (4 + 3 + 6 + 9) = 0.652 即GC content为65.2%。在实际应用中，通常会将GC content控制在一定范围内，以确保sgRNA的稳定性和可靠性。具体控制范围根据不同的实验目的和条件而有所差异。

赞同 0 0评论

关于作者

: DSM1120220857 注册会员
生信—基因编辑

0: 回答

0: 文章

13: 问题

问题动态

发布时间: 2023-06-27 20:47

更新时间: 2023-06-30 00:02

关注人数: 2 人关注

相关问题

linux下使用convert出现报错，可能是什么原因？如何解决？: 916 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

CUT&TAG 的GC含量异常: 512 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

奇异值分解在处理芯片数据时的意义是什么？: 653 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

第二代测序碱基出错偏向的原因是什么为什么第二代测序碱基出错主要以替换为主稀有碱基会影响测序吗: 870 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

WGCNA: 1120 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？: 930 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

编写shell脚本的if循环如下，结果运行的时候出现如下报错？原因是什么？大家学习shell变程的时候推荐哪些视频教程呢: 541 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

给我一份最新的cas9蛋白的sgRNA的数据集: 1124 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

poor oligo synthesis怎么理解，是什么意思呢: 751 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

WGCNA: 777 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问 fastANI: 807 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问关于拟南芥着色粒附近的变异数量: 891 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 the accessibility of sgRNA binding to the target site是什么意思，有详细解答嘛: 875 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问怎么用prokka做批量注释: 987 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

问 SMC++: 809 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

问获取所有基因的转录起始位点（TSS）: 1145 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 likelihood ratio test: 1153 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

问 EVM整合基因组注释: 831 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问本地blast最理想的结果是什么: 801 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024