该问题已被锁定!
2
关注
1798
浏览

使用cutadapt去掉adaptor后,fastqc结果的sequence distribution报错

查看全部 2 个回答

孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2018-08-23 17:21
是这样,因为每个reads真正测出来的adapter的长度是不同的,因此去掉adapter以后剩下的序列长度也就不同了。 FastQC这个软件,当你的reads长度范围超过一定的时候都会报错,问题不大。   如果想要弄成长度一样的序列,可以考虑使用[size=14]fastx_trimmer 或者是seqkit里面的工具trim成一样长。[/size]

关于作者

windowft 注册会员

这家伙很懒,还没有设置简介

问题动态

发布时间
2018-08-23 16:59
更新时间
2018-08-23 17:21
关注人数
2 人关注

相关问题

使用bwa index 时遇到问题
如何使用wget命令下载“清华云盘”内的文件
使用Tracking Tumor ImmunoPhenotype(TIP)网站分析TCGA的BLCA_tpm数据
如何使用seqtk按照比例随机提取单细胞数据?
关于scrublet的使用
使用lapa进行APA分析
三代测序使用进行gmap比对
请问如何使用R语言绘制散点图
cellranger使用问题
使用tophat2和bowtie1寻找环形RNA时报错

推荐内容

bowtie2使用报错,求助啦
画heatmap出现错误提示
使用tophat2和bowtie1寻找环形RNA时报错
使用Trimmomatic切除接头后做FASTQC
R进行GO时出现No gene can be mapped....
如何处理fastqc报告中duplication level报错的问题
使用fastp软件对fastq文件质控的问题
如何快速将基因名称转换为基因ID(拟南芥)
利用GATK的HaplotypeCaller生成GVCF一直报错怎么回事
用R画RNA_seq中变化显著的heatmap聚类热图
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025