celseq2转换单细胞原始数据 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

1002: 浏览

celseq2转换单细胞原始数据

单细胞RNA_seq

celseq2具体如何构建，我按照教程始终报错，请问有人成功过吗？

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 2 个回答

chatGPT机器人机器人用户来自于: 北京市
2023-05-29 16:21

是一种单细胞转录组测序技术，它的构建包括以下步骤：

细胞捕获与分离：celseq2使用微流控芯片对单个细胞进行捕获和分离，确保每个细胞由一个微小的反应室包裹。
细胞裂解：将细胞裂解并提取RNA。
原位翻转转录：celseq2使用一种独特的原位翻转转录方法，使得RNA被转录成为互补链，并带有随机的分子条形码，这些条形码可以用于区分来自不同细胞的RNA。
扩增：进行PCR扩增，扩增的产物含有每个细胞的RNA和分子条形码信息。
文库构建和测序：将扩增产物进行文库构建并进行高通量测序，得到单细胞转录组数据。关于celseq2转换单细胞原始数据的问题，可能会出现多种问题，如样本准备、实验操作等方面。

如果您始终报错，您可以先检查实验操作是否正确，是否有样本污染等可能的问题。如果问题依然存在，您可以参考其他实验室的操作流程或联系技术支持获取更多帮助。

赞同 0 1评论

关于作者

: Han1024 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

0: 回答

0: 文章

1: 问题

问题动态

发布时间: 2023-05-29 16:18

更新时间: 2023-06-06 11:18

关注人数: 2 人关注

相关问题

在单细胞测序中，不同组的T细胞统计检验方法: 1045 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

单细胞RNA-seq，如何计算不同cluster之间的相关性: 1024 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

chromosome名称转换的批量处理: 826 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

chipseq原始文件fastq如何截取DNA长度小于等于260bp进行后续mapping: 994 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

单细胞亚类聚类和相关细胞分析: 703 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

单细胞seurat对象的基因过滤: 2801 浏览 1 关注 3 回答 0 评论

GEO数据芯片数据基因名转换: 648 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

chromosome名称转换: 792 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

用wget 在服务器上用wget下载ENcode里的chip-seq测序原始数据，提示可以connected,但一直no data received ?: 846 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

单细胞数据的多个lib是什么意思呢？: 566 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问关于scrublet的使用: 1150 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问运行harmony后counts数变成小数: 823 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

问单细胞RNA-seq分析流程: 967 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问单细胞亚类聚类和相关细胞分析: 703 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问去除批次效应选定靶标细胞群后如何进行亚群分析？: 1073 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。初始数据命名为pbmc: 1064 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 cellranger运行结果分析: 817 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问单细胞RNA-seq，如何计算不同cluster之间的相关性: 1024 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 scRNA-seq有什么推荐的监督聚类方式吗？: 1066 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024