无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因

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使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。出现问题

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绵羊转录组测序后差异表达基因太多了

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基因本体论分析上下调基因差异

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如何通过重测序方法找到大耳朵狗和小耳朵狗的候选基因如何通过重测序方法找到大耳朵狗和小耳朵狗的候选基因，目前已经把测序得到的数据map 到了染色体上，不知道下一步该怎么找候选基因

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如何提取比对上某一个基因或者某一段序列的所有reads

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log2(fold_change)可以用来做热图吗？遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时，怎么办？

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使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。初始数据命名为pbmc

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在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下，如何利用cuffdiff进行差异基因分析。

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请问如何查询某基因的详细的Biological Function？

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