单细胞RNA-seq分析流程

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想问一个RNA-Seq的流程问题

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在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下，如何利用cuffdiff进行差异基因分析。

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rna-seq数据校正

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肿瘤样本的VAF值

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请教一个问题，一个转录因子TF只会调控位于同一条链的基因，还是有可能调控反义链的基因？

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【坐标北京】近期准备做一些RNA-seq，想请问一下大家哪些公司比较靠谱？-w-

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log2后的数据进行Wilcoxon秩和检验对结果存在什么影响？

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转录组组内样本差异大

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ATAC-seq不同测序量样本的差异比较

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问 【坐标北京】近期准备做一些RNA-seq，想请问一下大家哪些公司比较靠谱？-w-

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问 转录组

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问 GATK和Samtools联合寻找变异

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问 用atac-seq数据计算的TSS enrichment score

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问 seurat中如何通过坐标/细胞名删掉细胞

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问 多个处理组的RNAseq分析中关于counts表格合并的问题

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问 请问RNA-seq采用poly A(+)策略建库，处理数据时若不去除rRNA会对后续分析有何影响？

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问 公司双端测序的数据R1R2处理

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问 R语言作火山图问题

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问 RIP-seq有没有类似ChIP-seq的blacklist region合集？

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