你好chatGPT,可以提供包含双细胞去除的单细胞分析完整流程吗？

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请问hisat2+stringtie+deseq2的标准流程

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来自不同project的RNA-Seq数据可以直接合并分析吗？

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希望论坛设置一个新手入门专版

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RNA-seq logFC与pvalue

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菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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是不是单细胞的chip-seq，cut run这些call peak是不需要对照的，我看代码里没有-c.所以Rna-seq的峰图也是不需要control来call peak的吗？

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由cutesv流程鉴定到的SV有特别多的缺失基因型

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老铁们，我想问下，如果homer找到了motif1，那我有可能反过来知道哪些peak含有motif1么。

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如何按一个列表对基因型文件进行过滤，剔除不需要的样本？

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 20170804高通量测序视频中05 mapping.sh报错问题

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问 RNA-seq reads和表达量在转座子上的分布meta图

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问 RNA-seq count值和fpkm值不对应

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问 RNA-seq logFC与pvalue

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问 sRNA_seq分析

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问 RNA-seq差异分析

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问 关于cufflinks中cuffdiff的使用问题。

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问 多个处理组的RNAseq分析中关于counts表格合并的问题

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问 ATAC-seq与RNA-seq的联合分析

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