GATK和Samtools联合寻找变异

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通过富集得到了一些信号通路，我想看看这些通路里哪些是和癌症相关的，如何实现呢？

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ROSE算法寻找SEs

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无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因

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怎么寻找某个基因的不同可变剪切形式？

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用ls *sra |while read id; do fastq-dump --split-3 $id;done命令，去解压缩sra文件，出现部分报错是什么原因？

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如何通过重测序方法找到大耳朵狗和小耳朵狗的候选基因如何通过重测序方法找到大耳朵狗和小耳朵狗的候选基因，目前已经把测序得到的数据map 到了染色体上，不知道下一步该怎么找候选基因

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在GEO profile 下载sra文件，RunInfo Table 和accession list 有什么区别，下载哪个文件

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双端测序的sra文件，经过fastq-dump --split-3，出现3个结果是什么原因？如下图

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在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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问 有关蛋白表达定量的数据库数据打包下载(蛋白组学)

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