无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因

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转录组

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请问cytoscape是怎么构建网络的？

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请问一下大家生物信息学的生物学具体应用

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请问一下，使用conda install deeptools之后，出现如下报错，如何解决呢？

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转录组

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请问hemmer是否可以使用转录组搜索HMM库？

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请问UCSC上下载的参考基因组中这个文件是什么含义

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stringtie和gffcompare处理转录本的问题

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关于Cytoscape插件ClueGO的问题

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问 R进行GO时出现No gene can be mapped....

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问 无参基因组分析GO富集到了这一步不会做

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问 为什么我在做go的时候，用clusterProfiler富集没有结果，但是用网站http://geneontology.org/ 做就有很多呢？代码如图

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问 GO、KEGG分析中的showCategory是按照什么顺序来输出对应的条目的

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问 SOAPdenovo-Trans 组装的 contig 如何获得 gene_trans_map

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问 KEGG结果为空？

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问 在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下，如何利用cuffdiff进行差异基因分析。

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