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【求助】如何判断一个基因是否存在表观修饰的位点?
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【求助】如何判断一个基因是否存在表观修饰的位点?
甲基化预测
看了很多文献,大都是采用计算的方法对DNA甲基化进行预测,我想知道,是否存在一个简便的工具,例如, 对于玉米来说,是否存在一个数据库,可以通过上传基因ID,来自动判断这个基因上是否存在甲基化、磷酸化或其他表观修饰的潜在位点。
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孟浩巍
超级管理员
用户来自于: 北京市
2018-08-29 16:13
现在DNA甲基化最常用的办法是BS-Seq,直接就能测出来哪里是5mC。 人和小鼠的都有数据库,我刚才搜了搜玉米也有很多BS-Seq的数据,但是数据库没有搜到。 你可以下载一下他们的公共数据,然后来查询你说的某个gene位点是否有甲基化。 至于其他修饰,如果有好的修饰测序技术,当然就有数据,没有合适的技术就暂时木有数据了。当数据积累到一定程度的时候,就可以做数据库咯~ 以上。
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徐寅生
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这家伙很懒,还没有设置简介
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发布时间
2018-08-29 15:49
更新时间
2018-08-29 16:13
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