该问题已被锁定!
2
关注
1445
浏览

测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组,miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢?

查看全部 2 个回答

孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2018-08-24 22:55
不知道你是什么物种,因为动物和植物的miRNA还是挺不一样的,这里我以动物的miRNA为例。   1. miRNA几乎都是1对多的调控,甚至出现1个对几百个gene的情况; 2. 一般动物里面常用targetScan的结果当做miRNA的靶标预测结果,里面有打分,打分的高低显示gene可能受miRNA调控的保守程度。一般认为,1个miRNA对1个gene的分数越高,越可能调控这个gene。   因此,我建议,你可以选择打分比较高的,比如top10的gene去做下游的挖掘,是不是更有可能?

关于作者

问题动态

发布时间
2018-08-24 16:16
更新时间
2018-08-24 22:55
关注人数
2 人关注

推荐内容

cox回归问题
人工智能技术目前在生信分析中有哪些应用?
Bowtie2使用中遇到的内存不足问题
在riboseq分析中,如何对没有起始密码子和终止密码子的转录本进行三碱基准确性分析?
转录组组内样本差异大
ChIP-seq的bigwig文件可以使用rpkm>1过滤掉一些弱的信号吗?
高度杂合变异材料的遗传变异研究采取方法讨论
DiffBind 标准化数据
链特异性文库(mRNA/lncRNA/circRNA)如何将RNA类型分开?
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025