首页
问答
文章
专栏
大咖
更多
话题
帮助
请输入关键字进行搜索
查看更多 "
" 的搜索结果
登录
测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组,miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢?
关注问题
回答问题
该问题已被锁定!
2
关注
3177
浏览
测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组,miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢?
Cytoscape
生信分析
miRNA_mRNA互作分析
差异miRNA 几十个, 差异mRNA 有3000多个? 现在思路:1 . miRNA靶基因预测 与实际测序有差异的mRNA取交集, 然后找出miRNA-mRNA调控对,但是这个Cytoscape做出来节点有600多个,图根本就看不出来有什么意义。 各位大神是否有类似的分析思路给点建议? 或者有miRNA-mRNA互作分析的建议呢? 蟹蟹~~
阅读全文
收起全文
关注问题
回答问题
邀请回答
好问题
0
评论
收藏
举报
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
展开
收起
0
评论
查看全部
2
个回答
孟浩巍
超级管理员
用户来自于: 北京市
2018-08-24 22:55
不知道你是什么物种,因为动物和植物的miRNA还是挺不一样的,这里我以动物的miRNA为例。 1. miRNA几乎都是1对多的调控,甚至出现1个对几百个gene的情况; 2. 一般动物里面常用targetScan的结果当做miRNA的靶标预测结果,里面有打分,打分的高低显示gene可能受miRNA调控的保守程度。一般认为,1个miRNA对1个gene的分数越高,越可能调控这个gene。 因此,我建议,你可以选择打分比较高的,比如top10的gene去做下游的挖掘,是不是更有可能?
阅读全文
收起全文
赞同
1
1
评论
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
1
评论
关于作者
桶桶要好好学习
初级会员
这家伙很懒,还没有设置简介
1
回答
0
文章
4
问题
问题动态
发布时间
2018-08-24 16:16
更新时间
2018-08-24 22:55
关注人数
2 人关注
相关问题
Chip-seq bam文件的处理
3800 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
生信问题(我也不知道该怎么问)
2827 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
如何处理fastqc报告中duplication level报错的问题
4218 浏览
3 关注
2 回答
0 评论
Liux中gtftk closest_genes怎么使用?
2417 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
log2(fold_change)可以用来做热图吗?遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时,怎么办?
3314 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
chromosome名称转换 的批量处理
2278 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
seqtk的使用技巧,可以处理那些序列问题?
2258 浏览
1 关注
1 回答
0 评论
如何通过重测序方法找到大耳朵狗和小耳朵狗的候选基因如何通过重测序方法找到大耳朵狗和小耳朵狗的候选基因,目前已经把测序得到的数据map 到了染色体上,不知道下一步该怎么找候选基因
2581 浏览
3 关注
2 回答
0 评论
关于ceRNA网络构建的后续分析有哪些?
2105 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
R语言安装"Rhtslib"软件包,出现如下报错怎么办?
3956 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
推荐内容
问
链特异性文库(mRNA/lncRNA/circRNA)如何将RNA类型分开?
2520 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
植物TWAS流程
3464 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
23年生信NCCL室间质评
2779 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
使用deeptools生成ChIP-seq信号热图与谱图
6549 浏览
3 关注
2 回答
0 评论
问
用GWAS筛选受选择基因,样本数量不够,请问可以用选择消除分析吗
2520 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
GWAS和WGS的选择消除分析有什么区别呀?
2557 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
cox
2343 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
ATAC-seq样本重复数
2647 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
ChIP-seq的bigwig文件可以使用rpkm>1过滤掉一些弱的信号吗?
3030 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
问
生信行业目前薪资怎样?谈谈吧
4148 浏览
5 关注
5 回答
0 评论
All Rights Reserved Powered BY
WeCenter V4.1.0
© 2026
关于我们
社区规范
你的浏览器版本过低,可能导致网站部分内容不能正常使用!
为了能正常使用网站功能,请使用以下浏览器
Chrome
Firefox
Safari
IE 10+