首页
问答
文章
专栏
大咖
更多
话题
帮助
请输入关键字进行搜索
查看更多 "
" 的搜索结果
登录
测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组,miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢?
关注问题
回答问题
该问题已被锁定!
2
关注
2062
浏览
测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组,miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢?
Cytoscape
生信分析
miRNA_mRNA互作分析
差异miRNA 几十个, 差异mRNA 有3000多个? 现在思路:1 . miRNA靶基因预测 与实际测序有差异的mRNA取交集, 然后找出miRNA-mRNA调控对,但是这个Cytoscape做出来节点有600多个,图根本就看不出来有什么意义。 各位大神是否有类似的分析思路给点建议? 或者有miRNA-mRNA互作分析的建议呢? 蟹蟹~~
阅读全文
收起全文
关注问题
回答问题
邀请回答
好问题
0
评论
收藏
举报
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
展开
收起
0
评论
查看全部
2
个回答
孟浩巍
超级管理员
用户来自于: 北京市
2018-08-24 22:55
不知道你是什么物种,因为动物和植物的miRNA还是挺不一样的,这里我以动物的miRNA为例。 1. miRNA几乎都是1对多的调控,甚至出现1个对几百个gene的情况; 2. 一般动物里面常用targetScan的结果当做miRNA的靶标预测结果,里面有打分,打分的高低显示gene可能受miRNA调控的保守程度。一般认为,1个miRNA对1个gene的分数越高,越可能调控这个gene。 因此,我建议,你可以选择打分比较高的,比如top10的gene去做下游的挖掘,是不是更有可能?
阅读全文
收起全文
赞同
1
1
评论
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
1
评论
关于作者
桶桶要好好学习
初级会员
这家伙很懒,还没有设置简介
1
回答
0
文章
4
问题
问题动态
发布时间
2018-08-24 16:16
更新时间
2018-08-24 22:55
关注人数
2 人关注
相关问题
Ubuntu 14.04 server,如何进行网络配置呢?
1611 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
利用GATK的HaplotypeCaller生成GVCF一直报错怎么回事
2388 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。
1503 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
blastp后,我想提取score的序列,请问使用python应该怎么写这个脚本
1618 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
annovar建立非模式物种注释库后怎么分析
1646 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
Chip-seq bam文件的处理
2826 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
求助一个shell脚本问题,如何批量处理下面这种情况?
1559 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
怎么对基因启动子含有什么元件进行分析
1719 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
harmony整合样本前需要分别预处理吗?
2269 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
进行转录组数据分析时,进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中,一个基因出现了两个不同的表达量数据,应该如何处理?
1495 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
推荐内容
问
chipseq分析,利用deeptools的computeMatrix reference-point画样本的peak center信号图
3052 浏览
3 关注
2 回答
0 评论
问
cox回归问题
2064 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
ATAC-seq绘制TSS富集图
3261 浏览
2 关注
2 回答
2 评论
问
尿代谢组正负离子数据标准化是否可以均用正离子检测出来的肌酐峰
1448 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
使用deeptools生成ChIP-seq信号热图与谱图
4619 浏览
3 关注
2 回答
0 评论
问
ChIP-seq的bigwig文件可以使用rpkm>1过滤掉一些弱的信号吗?
2137 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
问
人工智能技术目前在生信分析中有哪些应用?
1004 浏览
1 关注
0 回答
0 评论
问
用GWAS筛选受选择基因,样本数量不够,请问可以用选择消除分析吗
1662 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
Bowtie2使用中遇到的内存不足问题
2204 浏览
1 关注
2 回答
0 评论
All Rights Reserved Powered BY
WeCenter V4.1.0
© 2025
关于我们
社区规范
你的浏览器版本过低,可能导致网站部分内容不能正常使用!
为了能正常使用网站功能,请使用以下浏览器
Chrome
Firefox
Safari
IE 10+