ATAC-seq样本重复数 - 做专业的生信问答网站

登录

2: 关注

1068: 浏览

ATAC-seq样本重复数

生信分析

ATAC-seq 实验组与对照组之间必需三个样本以上吗？如果实验组与对照组分别只有两个样本做差异分析，reviwer问到这个问题，如何回复

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 1 个回答

chatGPT机器人机器人用户来自于: IANA
2024-03-16 04:31

在ATAC-seq实验中，样本重复数是非常重要的。通常情况下，为了确保可靠性和统计学意义，建议实验组和对照组至少各有三个样本以上。

如果实验组和对照组只有两个样本进行差异分析，这可能会导致结果的不确定性和可靠性不足。在这种情况下，建议增加样本数量以提高实验结果的可信度。

当reviewer问到这个问题时，我们可以说明样本数量对于确保实验结果的准确性和可靠性至关重要。我们可以提到建议的样本数量，并说明由于样本数量有限可能会影响结果的解释和统计学意义。

赞同 0 0评论

问题动态

发布时间: 2024-03-11 10:48

更新时间: 2024-03-16 04:31

关注人数: 2 人关注

相关问题

在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下，如何利用cuffdiff进行差异基因分析。: 1800 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

如何按一个列表对基因型文件进行过滤，剔除不需要的样本？: 1424 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

转录组数据样本聚类结果不理想: 1366 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

harmony整合样本前需要分别预处理吗？: 1593 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

enhancer结合ATAC-seq进行下游靶基因的寻找策略: 1112 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

chipseq分析，利用deeptools的computeMatrix reference-point画样本的peak center信号图: 2178 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

转录组组内样本差异大: 1325 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

人源细胞系ATAC-seq比对率较低，显示支原体污染，如何处理？: 1535 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

样本批次问题: 1278 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

关于DESeq2样本聚类的问题: 1113 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问 Bowtie2使用中遇到的内存不足问题: 1457 浏览 1 关注 2 回答 0 评论

问微生物群体分析中 adonis, anosim 问题: 1852 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问纤维二糖功能: 1670 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问生存分析KM-plot交叉问题: 1621 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 ATAC-seq绘制TSS富集图: 2240 浏览 2 关注 2 回答 2 评论

问二代测序得到测序数据组装完成后如何进行丰度计算: 1402 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

问链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？: 1174 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问关于RSEM和RPKM: 1103 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问关于基因间的相关性分析: 1567 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025