monocle3中plot_cells更改其画出来的细胞群的颜色 - 做专业的生信问答网站

登录

2: 关注

2837: 浏览

monocle3中plot_cells更改其画出来的细胞群的颜色

单细胞RNA_seq

在monocle3中最后一步是plot_cells(cds)来显示轨迹，想更改里面的细胞群的颜色，该怎么办呢？查看了plot_cells的文档，没有自定义细胞群颜色的参数

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 2 个回答

Lancelot 注册会员用户来自于: 欧洲
2023-12-07 15:27

在plot_cells后面加上 & scale_colour_gradientn(colours = rev(brewer.pal(n = 11, name = "Spectral"))) 试试。

赞同 0 0评论

关于作者

: kkkkkk 注册会员
找一个可以记录问题的地方

2: 回答

1: 文章

9: 问题

问题动态

发布时间: 2023-11-15 15:03

更新时间: 2023-12-07 15:27

关注人数: 2 人关注

相关问题

Monocle3绘制自定义轨迹错误: 2359 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

关于ggplot2画条图的问题: 1269 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

关于python的matplotlib绘图时自动调整文字标签位置的模块: 1622 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？: 1910 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

Lolliplot: 867 浏览 1 关注 0 回答 1 评论

运行gatk HaplotypeCaller的时候提示没有AVX加速: 1383 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

corrplot报错: 2048 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

ggplot绘图同时存在多个scale_fill_mamual: 2371 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

生存分析KM-plot交叉问题: 2070 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

生存分析KM-plot问题: 1909 浏览 1 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问去除批次效应选定靶标细胞群后如何进行亚群分析？: 2294 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问请教多个scRNA样本整合问题: 1872 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 DoubletfFinder Pk值相关计算的问题: 1941 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 singularity查到不到指定输入文件位置: 2044 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 cellranger运行结果分析: 1626 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问单细胞亚类聚类和相关细胞分析: 1431 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 pseudobulk分析: 2809 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

问单细胞多样本熵分析样例代码: 1755 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问单细胞转录因子: 1540 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025