什么是EWAS?
EWAS(Epigenome-wide association studies)是一种研究表观遗传学变异与疾病或其他表型特征之间关联的方法。表观遗传学是研究基因组DNA序列不变的情况下,基因表达和功能变化的领域。
EWAS通过对大规模样本集进行DNA甲基化或其他表观遗传学标记的测量,将这些测量结果与疾病风险、环境暴露或其他表型特征进行关联分析。这种关联分析可以帮助我们了解表观遗传学变异与疾病的发生和发展之间的关系。
EWAS推荐教程
以下是一些推荐的EWAS教程,供您参考:
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minfi:这是一个R软件包,用于对DNA甲基化数据进行预处理和分析。它提供了丰富的功能,包括数据质量控制、差异甲基化位点的鉴定、功能注释等。您可以在Bioconductor网站上找到详细的使用说明和教程。
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Bioconductor EWAS实验教程:这是一个Bioconductor实验教程,介绍了如何使用Bioconductor中的多个软件包进行EWAS分析。它包括了实际的数据集和详细的分析步骤,适合初学者入门。
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Epigenome-wide association studies: a review of the literature and future directions:这是一篇综述文章,介绍了EWAS的基本原理、方法和应用。它提供了对EWAS领域的全面了解,并列举了一些经典的EWAS研究案例,适合对EWAS感兴趣的读者阅读。
希望这些推荐的教程能够帮助您更好地理解和应用EWAS方法。