该问题已被锁定!
2
关注
1501
浏览

什么是EWAS?有没有推荐的EWAS推荐教程?

为什么被折叠? 0 个回复被折叠
chatGPT机器人 机器人 用户来自于: IANA
2023-07-06 19:53

什么是EWAS?

EWAS(Epigenome-wide association studies)是一种研究表观遗传学变异与疾病或其他表型特征之间关联的方法。表观遗传学是研究基因组DNA序列不变的情况下,基因表达和功能变化的领域。

EWAS通过对大规模样本集进行DNA甲基化或其他表观遗传学标记的测量,将这些测量结果与疾病风险、环境暴露或其他表型特征进行关联分析。这种关联分析可以帮助我们了解表观遗传学变异与疾病的发生和发展之间的关系。

EWAS推荐教程

以下是一些推荐的EWAS教程,供您参考:

  1. minfi:这是一个R软件包,用于对DNA甲基化数据进行预处理和分析。它提供了丰富的功能,包括数据质量控制、差异甲基化位点的鉴定、功能注释等。您可以在Bioconductor网站上找到详细的使用说明和教程。
  2. Bioconductor EWAS实验教程:这是一个Bioconductor实验教程,介绍了如何使用Bioconductor中的多个软件包进行EWAS分析。它包括了实际的数据集和详细的分析步骤,适合初学者入门。
  3. Epigenome-wide association studies: a review of the literature and future directions:这是一篇综述文章,介绍了EWAS的基本原理、方法和应用。它提供了对EWAS领域的全面了解,并列举了一些经典的EWAS研究案例,适合对EWAS感兴趣的读者阅读。

希望这些推荐的教程能够帮助您更好地理解和应用EWAS方法。

关于作者

问题动态

发布时间
2023-07-06 19:48
更新时间
2023-07-06 19:53
关注人数
2 人关注

相关问题

奇异值分解在处理芯片数据时的意义是什么?
编写shell脚本的if循环如下,结果运行的时候出现如下报错?原因是什么? 大家学习shell变程的时候推荐哪些视频教程呢
亲问大家有没有chip-seq入门相关的教程?
双端测序的sra文件,经过fastq-dump --split-3,出现3个结果是什么原因?如下图
Affy包中的MAplot函数的作用是什么?画出的MAplot图如何解读?为何要进行MAplot检查?
bioPython1.72版本怎么安装,我在Python子文件夹里找到Bio和bioPython1.72.dist-info,可在Python界面就是导不入,有没有大神解答一下
在很多分析表达谱芯片的教程中,使用limma 包寻找差异表达基因,都是先找到差异表达探针,再把探针注释为基因id,为何不先进行注释再计算差异表达呢?这两种方法有什么区别呢?
为什么我在做go的时候,用clusterProfiler富集没有结果,但是用网站http://geneontology.org/ 做就有很多呢?代码如图
riboseq中frame指的是什么,是如何确定的,通过riboseq如何知道一个基因的开放阅读框
limma中的Removing heteroscedascity from count data和拟合线性模型是什么意思?

推荐内容

cut tag 测序相关问题
poor oligo synthesis怎么理解,是什么意思呢
甲基化
表观遗传学未来发展趋势是什么?
亚群分类超参数设定
RNA结合蛋白数据库
表观遗传学标记
异染色质和 Compartment B
H3K27ac occupancy怎么定义?
epigenome editing tools
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025