该问题已被锁定!
2
关注
1437
浏览

测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组,miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢?

为什么被折叠? 0 个回复被折叠
孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2018-08-24 22:55
不知道你是什么物种,因为动物和植物的miRNA还是挺不一样的,这里我以动物的miRNA为例。   1. miRNA几乎都是1对多的调控,甚至出现1个对几百个gene的情况; 2. 一般动物里面常用targetScan的结果当做miRNA的靶标预测结果,里面有打分,打分的高低显示gene可能受miRNA调控的保守程度。一般认为,1个miRNA对1个gene的分数越高,越可能调控这个gene。   因此,我建议,你可以选择打分比较高的,比如top10的gene去做下游的挖掘,是不是更有可能?
海王坑 前台管理员 用户来自于: 湖北省武汉市
2018-08-24 21:51
这个还是得基于具体的生物学意义去分析互作网络,去看别人文献吧

关于作者

问题动态

发布时间
2018-08-24 16:16
更新时间
2018-08-24 22:55
关注人数
2 人关注

推荐内容

尿代谢组正负离子数据标准化是否可以均用正离子检测出来的肌酐峰
纤维二糖功能
computeMatrix画图问题
ATAC-seq绘制TSS富集图
ATAC-seq样本重复数
转录组组内样本差异大
关于ceRNA网络构建的后续分析有哪些?
Monocle3绘制自定义轨迹错误
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025