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GEOquery下载GEO数据软件报错

小弟我R刚入门，正在学习使用R软件GEOquery包下载数据，使用getGEO后弹出以下错误提示： Error in get0(oNam, envir = ns) : cannot open file 'C:/Users/Kumawife/Documents/R/win-library/3.5/stringi/R/stringi.rdb': No such file or directory In addition: Warning message: In get0(oNam, envir = ns) : restarting interrupted promise evaluation 虽然报错，但是仍然在目的地文件夹里面找到了一个压缩文件：GSE36552_series_matrix.txt.gz 求各位帮忙看看怎么解决~~ 谢谢大家！

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3 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-08-23 20:53

windows下这个包总是出各种各样的问题，建议使用Linux环境运行。同时，[size=14]GSE36552_series_matrix.txt.gz这个文件本身就可以读到R里面，只不过不如能生成标准的Experiment Set类型。我觉得不影响你的下游分析。[/size]

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fcdslz 超级管理员用户来自于: 北京市
2018-08-23 20:36

你竟然能下载到文件。。。我这边直接报了一个SSL链接错误，我排了1周了都解决不了。。。

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minipeach 前台管理员用户来自于: 重庆市北碚区
2018-08-23 21:58

我觉得你可以尝试先设置一下工作目录，看能不能解决。

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关于作者

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这家伙很懒，还没有设置简介

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发布时间: 2018-08-23 18:57

更新时间: 2018-08-23 21:58

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