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单细胞RNA-seq,如何计算不同cluster之间的相关性
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单细胞RNA-seq,如何计算不同cluster之间的相关性
单细胞RNA_seq
该图描述的是单细胞RNA-seq中20个cluster之间的相关性比较,如果我用R中的cor函数计算相关性,我只能得到所有细胞之间两两比较的相关性。那么采用哪种评估标准,可以用一个值或一个向量代表一个cluster的身份,并得到图中这种cluster与cluster之间的相关性呢? [attach]248[/attach]
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孟浩巍
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用户来自于: 北京市
2018-09-20 21:55
你可以去看一下paper里是怎么计算的,无外乎就是这么几个思路: 1. 选择cluster细胞中的平均情况,然后计算; 2. 选择cluster细胞中的代表情况,然后计算; 3. 选择cluster细胞中的一些特征信息,然后计算;
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杨麻麻
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这家伙很懒,还没有设置简介
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发布时间
2018-09-20 21:05
更新时间
2018-09-20 21:55
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