一个cohort中，某基因count大于多少才有意义？

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最近在测试有一个可变剪切的软件，听说比rmats效果好

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请教一个问题，一个转录因子TF只会调控位于同一条链的基因，还是有可能调控反义链的基因？

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stringtie 得到的gtf 通过DESeq2分析后stringtieID 如何转换成esmbleID

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在N-W算法中，为什么忽略了从x状态道y状态的转化（xi对应到一个空位到yi对应一个空位的转化）

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关于ceRNA网络构建的后续分析有哪些？

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关于RSEM和RPKM

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进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，一个基因出现了两个不同的表达量数据，应该如何处理？

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关于tophat2 + cufflinks 得到的差异基因和featureCounts差异基因数目相差太大原因

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菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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