stringtie 得到的gtf 通过DESeq2分析后stringtieID 如何转换成esmbleID - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

3: 关注

842: 浏览

stringtie 得到的gtf 通过DESeq2分析后stringtieID 如何转换成esmbleID

stringtie

好问题 0 评论收藏举报

2 回答

刘上初级会员用户来自于: 河南省安阳市
2018-09-18 09:09

这是孟叔图片来源的转录组分析文章，以及自己整理的这篇文章的转录组分析流程

赞同 2 0评论

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-17 21:29

你现在貌似还没有做gffcompare，看一下stringtie的处理流程： [attach]230[/attach]

赞同 0 1评论

关于作者

: jiamin_2018 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

0: 回答

0: 文章

4: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-17 20:27

更新时间: 2018-09-18 09:09

关注人数: 3 人关注

相关问题

Liux中gtftk closest_genes怎么使用？: 767 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

对于BLAST算法在高歌老师的课上提到运用哈希函数和有限自动机的模型去提高数据检索效率，不是很理解其中的原理，希望得到大神们的帮助: 1065 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

Hichip得到loop数据如何注释？: 806 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

HTseq gtf文件的选择: 906 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

通过富集得到了一些信号通路，我想看看这些通路里哪些是和癌症相关的，如何实现呢？: 1109 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？: 511 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

通过SRA编号寻找对应的文章: 803 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

二代测序得到测序数据组装完成后如何进行丰度计算: 938 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

stringtie 与DESeq2: 407 浏览 1 关注 0 回答 1 评论

Linux下，通过循环批量拷贝文件。: 804 浏览 3 关注 2 回答 1 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024