无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因

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双端测序的sra文件，经过fastq-dump --split-3，出现3个结果是什么原因？如下图

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aspera SRA 数据批量下载

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SRA、SRP、SRX、RUN等一些列NCBI genebank数据库中的一些缩略词官方解释或者全称，谢谢，虽然做了一段时间生信但是对这些小问题并没有重视，希望大家解答

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在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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使用tophat2和bowtie1寻找环形RNA时报错

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用ls *sra |while read id; do fastq-dump --split-3 $id;done命令，去解压缩sra文件，出现部分报错是什么原因？

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如何根据现有序列找到它们在三代基因组的编号

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SRA 数据批量下载

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根据已知序列查找其第三代基因组编号

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问 有关蛋白表达定量的数据库数据打包下载(蛋白组学)

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