RNA Seq中什么样的reads是chimeric reads？是不是多数的chimeric reads都是circRNA的？ - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

1405: 浏览

RNA Seq中什么样的reads是chimeric reads？是不是多数的chimeric reads都是circRNA的？

生信问题

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-05 13:11

因为测序的时候是Read1和Read2是头对头，切分布在2条链上，所以在正常mapping回去的时候也应该是Read1和Read2是头对头，切分布在2条链上。但是如果是circRNA被测序到，这个测序就会出问题，就会出现本来应该出现两种朝向完全相反的情况，当出现这种情况的时候，就是你要的circRNA序列。

赞同 0 0评论

问题动态

发布时间: 2018-09-05 12:49

更新时间: 2018-09-05 13:11

关注人数: 2 人关注

相关问题

RNA-seq分析，rlog需要生物学重复才行？有别的Normalization方法吗？: 1359 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

sRNA_seq分析: 1099 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

scRNA-seq有什么推荐的监督聚类方式吗？: 1591 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

来自不同project的RNA-Seq数据可以直接合并分析吗？: 1708 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

16s rRNA分析中的标准化: 1208 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

rna-seq数据校正: 1550 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

如何筛选小鼠lncRNA?: 1281 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

使用deeptools生成ChIP-seq信号热图与谱图: 3720 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

RNA-seq logFC与pvalue: 1116 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

enhancer结合ATAC-seq进行下游靶基因的寻找策略: 1351 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问关于基因间的相关性分析: 1722 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问使用tophat2和bowtie1寻找环形RNA时报错: 1940 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问使用bedtools提取序列时的deyond length问题；bed负值: 2227 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问请问下这种格式的R语言内容如何选择最小值: 1520 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 SPSS报错: 1542 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问如何按一个列表对基因型文件进行过滤，剔除不需要的样本？: 1648 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 L1插入位点的百分比密度分布: 1411 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？: 1342 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025