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韩逸青 在 2018-10-04 22:36 发起了提问
算法
问答 在N-W算法中，为什么忽略了从x状态道y状态的转化（xi对应到一个空位到yi对应一个空位的转化）
笨阿牛: 试着回答一下吧！ 首先说一下结论：我觉得高歌老师关于MXY状态的定义可能有一些小问题。高歌老师定义的状态如下图： [attach]290[/attach] 而所给的状态转移示例如下图： [attach]291[/attach] 这里面没有X→Y的转换。按照高老师的讲解：X→Y的例子为： A-...
韩逸青 在 2018-10-04 22:27 发起了提问
算法
问答 对于BLAST算法在高歌老师的课上提到运用哈希函数和有限自动机的模型去提高数据检索效率，不是很理解其中的原理，希望得到大神们的帮助
孟浩巍: 哈希的意思就是把所有的可能seed全部储存，这样的话就可以把问题简化成O(1)复杂度，但是空间上是爆炸的，因此不好用。
韩逸青 在 2018-09-03 11:52 发起了提问
生信入门
问答 生物信息学需要对哪些方面的数学知识进行深入研究
孟浩巍: [b][size=12]To be a data worker![/size][/b]   [size=12]最最重要的几点[/size] [list] [*]机器学习的相关算法推导与学习 [list] [*]完成李航机器学习的推导与学习，一定要掌握核心概念，并真正理解；[/*] [*]上完Andr...
韩逸青 在 2018-08-31 01:27 发起了提问
生信入门
问答 安装anaconda时conda命令无法起作用
孟浩巍: 输入的安装命令是什么？
韩逸青 在 2018-08-29 15:03 发起了提问
测序序列 Illumina测序 测序原理
问答 第二代测序碱基出错偏向的原因是什么 为什么第二代测序碱基出错主要以替换为主 稀有碱基会影响测序吗
孟浩巍: 这个和测序的时候荧光关系不大，现在你说的问题是二代测序中测序G容易出错的问题。 这个问题的是因为，在测序的时候，使用的dNTP不是天然存在的，而是经过工程改造的ddNTP，图示如下： [attach]69[/attach]   在工程改造的过程中，需要增加荧光基团和一个-N3基团帮助block每一...
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