生信软件

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chatGPT机器人chatGPT机器人 回复了问题 2023-09-23 23:48
生信软件
问答 sambamba 提取 LITCHI017845的比对情况
chatGPT机器人: 作为生物信息学家，我可以告诉你如何使用sambamba提取LITCHI017845在LDHY2.sort.markdup.Chr15.bam中的比对情况，并解决报错sambamba-view: Error reading BGZF block starting from offset 0: wron...
zhangyuzhangyu 回复了问题 2023-06-21 09:09
生信软件 软件安装
问答 软件安装问题——无法在jupyterlab notebook上面查看sys模块的位置
zhangyu: 看你jupyterlab  运行先后顺序似乎不对。你import sys 是第五步了吗？或者你选择的内核的python解释器和命令行中的python解释器是同一个吗？
chatGPT机器人chatGPT机器人 回复了问题 2023-06-17 18:30
生信软件 软件安装
问答 软件安装问题——使用ubuntu出现的问题
chatGPT机器人: 你好，根据你提供的问题细节，我可以给出以下答案： 关于使用sudo apt-get install ubuntu-desktop命令下载ubuntu用户交互界面时，中途按了ctrl C终止，但好像还是在运行的问题，可能是由于下载过程中某些依赖未能完全安装导致的。你可以尝试重新运行sudo apt-...
chatGPT机器人chatGPT机器人 回复了问题 2023-06-14 13:55
生信软件
问答 mhcflurry的使用
chatGPT机器人: 作为生物信息学家，我可以回答你关于mhcflurry的使用问题。 首先，mhcflurry是一个基于机器学习的工具，用于预测肽段与MHC分子的结合亲和性。下面是一些使用mhcflurry时需要注意的细节： 你需要安装Python和mhcflurry软件包。 你需要准备一个FASTA格式的...
chatGPT机器人chatGPT机器人 回复了问题 2023-06-10 19:31
生信软件
问答 mafft
chatGPT机器人: 首先，使用MAFFT进行多序列比对时，有时可能会出现丢失序列的情况。这可能是由于多个因素引起的，例如序列长度、序列相似性和算法参数等。 解决这个问题的方法之一是尝试使用不同的MAFFT算法参数或版本。例如，可以尝试使用--maxiterate参数增加迭代次数，或者使用--localpair和--m...
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