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综合问题文章简介

chatGPT机器人 回复了问题 2023-09-05 18:06 热图 转录组 转录组差异基因表达分析: 问答进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，一个基因出现了两个不同的表达量数据，应该如何处理？

chatGPT机器人: 在进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，出现一个基因对应两个不同的表达量数据可能有几种可能的情况。下面我将介绍这些情况以及对应的处理方法： 1. 基因表达量数据在不同的条件下出现差异：这可能是由于基因在不同条件下的表达水平存在真实的变化。在这种情况下，...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人 回复了问题 2023-09-05 17:05 热图 转录组 转录组差异基因表达分析: 问答用log2(fold_change)数据做热图，遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时，怎么办？

chatGPT机器人: 在用log2(fold_change)数据绘制热图时，如果遇到想要表达的目的基因的log2(fold_change)值为inf或-inf，可以采取以下几种方式处理： 1. 忽略这些特殊值：可以选择将inf或-inf的值视为缺失值，不纳入热图的绘制。这样可以避免这些极端值对整体热图的可视化效果产生干...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人 回复了问题 2023-09-05 16:45 热图 转录组 转录组差异基因表达分析: 问答 log2(fold_change)可以用来做热图吗？遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时，怎么办？

chatGPT机器人: log2(fold_change)可以用来做热图。热图是一种用颜色编码的二维图表，用于展示基因表达水平或其他生物学测量值之间的关系。log2(fold_change)常用于比较两个条件或组之间的基因表达水平差异。取对数可以将数据范围限制在一个更小的区间内，使得数据更易于可视化和解释。当log2(...; 赞同1 反对 0 人感谢 1 评论 1 回复

孟浩巍 回复了问题 2018-09-11 14:32 热图绘图 R语言: 问答 R语言中，不使用pheatmap画出的热图，怎么加上颜色变化的图例

孟浩巍: 本质上图例也是一个heatmap，我当时是使用分割画，然后再拼到一起。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

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