有你就足够 回复了问题 2018-08-27 08:58

linux网络配置

问答 【求助】在Ubuntu如何上网

有你就足够: 一般都是ping命令检测一下，在具体情况分析

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Jarning 回复了问题 2018-08-26 08:36

序列处理

问答 如何知道自己测序的adapter序列？

Jarning: 可以利用fastqc先对你手里的数据进行质控，在fastqc report中的最后一栏 里，fastqc会将你数据中的adapter列出。参考fastqc的官方文档： [url]https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/He...

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孟浩巍 回复了问题 2018-08-25 13:05

生信入门

问答 亲问大家有没有chip-seq入门相关的教程？

孟浩巍: 我觉得，ChIP-Seq最标准的流程，当然是跟着ENCODE的pipeline走咯！ [url=https://www.encodeproject.org/pages/pipelines/#DNA-binding]ENCODE-ChIP-Seq处理pipeline[/url]

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孟浩巍 回复了问题 2018-08-24 23:09

芯片数据分析 R Affy芯片 质量控制 RNASeq数据处理

问答 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

孟浩巍: MAplot是一个非常好的质控图，无论是在芯片数据分析中还是在RNA-Seq数据分析中都是经常使用的。   假设有ctrl和treat两组数据，gene K的表达量分别是 ctrl[K] 和 treat[K]，   MAplot的X轴就是每一个gene的几何平均数的log2值， M[K] = 0.5...

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jailyn 回复了问题 2018-08-24 13:06

日常吐槽贴

问答 想说爱你不容易

jailyn: 做完之后，感觉像十项全能

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Eric 回复了问题 2018-08-24 10:33

生信入门

问答 seqtk的使用技巧，可以处理那些序列问题？

Eric: 常用的例子都有 [url]https://github.com/lh3/seqtk[/url]

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孟浩巍 回复了问题 2018-08-23 14:45

芯片数据分析

问答 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

孟浩巍: 芯片数据分析，大概可以分成这么几个步骤： [attach]10[/attach] 分别是背景矫正（background correction） -> 归一化（normalization） -> 合并探针 （summarization）   每一步的算法最常用的如下： [attach]11[/a...

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