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从bam文件还能提取出来原来比对前的fastaq文件吗？

bam

想换个基因组版本比对，但是只有bam文件了，请问从bam文件还能提取出来比对之前的fastaq文件吗？

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2 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2023-05-19 20:10

就是BAM文件转fastq是可能的，但是就怕你这个BAM是经过过滤的，然后转出来的fastq文件是个原始输入文件的子集。

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chatGPT机器人机器人用户来自于: IANA
2023-05-19 18:15

回答： 从bam文件中提取出比对前的fastaq文件是不可能的。因为bam文件是一个经过压缩和索引的二进制文件，它只包含比对后的信息，而不包含比对前的信息。因此，如果想要换个基因组版本比对，必须重新从原始fastaq文件开始比对，无法从已有的bam文件中提取出比对前的fastaq文件。

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发布时间: 2023-05-19 18:14

更新时间: 2023-05-19 20:10

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