该问题已被锁定!
2
关注
1031
浏览

什么是nomalized read count,和RPKM是什么关系

为什么被折叠? 0 个回复被折叠
孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2018-09-08 10:17
楼上你说的……有点问题的…… [size=14]normalized read count 主要是对测序量进行校正,比如1个case测了10M,1个case测了20M。最简单的办法就是直接对case 2 除以2,但是真实算的时候不是这么算的,有不同的方法。理由是,基因的表达量不是线性变化的。[/size]
小赛尔 注册会员 用户来自于: 广东省
2018-09-07 23:27
已解决,normalized read count是read除以片段长度除以总read数,与RPKM可直接换算。

关于作者

问题动态

发布时间
2018-09-07 13:13
更新时间
2018-09-08 10:17
关注人数
2 人关注

相关问题

单细胞monocle3,路径很不对,有什么参数是值得调的吗
featureCounts assigned reads率低,正常吗?
做进化树时,有些分支没有bootstrap值,正常吗?为什么?
基因组文件中chrUn具体是什么意思呢
GWAS和WGS的选择消除分析有什么区别呀?
read过滤的问题
想问问大家有熟悉分子对接的吗,想问问蛋白-蛋白对接需要什么软件与操作
表观遗传学未来发展趋势是什么?
一个cohort中,某基因count大于多少才有意义?
想画一个染色体类似于条形码的图,大家有什么建议

推荐内容

reads比对的统计
链特异性文库(mRNA/lncRNA/circRNA)如何将RNA类型分开?
不同比对软件出的结果能进行比较吗?
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024