TWAS联合PWAS做 conditional analysis

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使用tophat2和bowtie1寻找环形RNA时报错

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GATK call snp跳过了好大一块

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在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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两个samtools命令之间用管道连接，最后的输出文件被吞了。

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ROSE算法寻找SEs

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samtools view筛选cellranger比对结果

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无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因

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不同样品中寻找特异的OTU

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求助GATK 说明书

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问 seurat中如何通过坐标/细胞名删掉细胞

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问 RNA-seq，样本中存在同一基因对应不同的FPKM值

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问 转录组

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问 RIP-seq有没有类似ChIP-seq的blacklist region合集？

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问 RNA-seq分析，rlog需要生物学重复才行？有别的Normalization方法吗？

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问 RNA-seq不同样本多个生物学重复不同处理条件下的如何找差异基因

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问 用atac-seq数据计算的TSS enrichment score

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问 多个处理组的RNAseq分析中关于counts表格合并的问题

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问 【坐标北京】近期准备做一些RNA-seq，想请问一下大家哪些公司比较靠谱？-w-

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问 请问RNA-seq采用poly A(+)策略建库，处理数据时若不去除rRNA会对后续分析有何影响？

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