首页
问答
文章
专栏
大咖
更多
话题
帮助
请输入关键字进行搜索
查看更多 "
" 的搜索结果
登录
如何在差异表达前消除批次效应
关注问题
回答问题
该问题已被锁定!
2
关注
799
浏览
如何在差异表达前消除批次效应
edgeR
批次效应
差异表达
大家好, 我目前手头有一count数据,但数据存在一个批次效应,预先消除批次效应再通过edgeR做差异表达。 想法是这样, raw counts --> remove batch effect --> new counts --> edgeR 但是用removebatcheffect()函数消除批次效应后,count就不是count了,也就不是整数了,不符合导入edgeR的要求。 求解 谢谢。
阅读全文
收起全文
关注问题
回答问题
邀请回答
好问题
0
评论
收藏
举报
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
展开
收起
0
评论
查看全部
1
个回答
i_thinking
注册会员
用户来自于: 美国
2018-08-24 11:12
可以试试deseq2
阅读全文
收起全文
赞同
0
2
评论
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
2
评论
关于作者
Sugus
注册会员
这家伙很懒,还没有设置简介
1
回答
0
文章
1
问题
问题动态
发布时间
2018-08-24 11:04
更新时间
2018-08-24 11:12
关注人数
2 人关注
相关问题
差异可变剪接分析工具--rMATS-结果分析
1011 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
蛋白表达矩阵
422 浏览
1 关注
1 回答
0 评论
ciriRNA表达量如何计算?
851 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
ciriRNA表达量如何计算?(更)
629 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
使用MAS5.0处理过的芯片数据,能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因,为什么不能?
763 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
转录组组内样本差异大
362 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
如何在 bioinfo.info 建立第一天留下自己的名字?
2627 浏览
13 关注
13 回答
1 评论
用log2(fold_change)数据做热图,遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时,怎么办?
573 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
对突变组和对照组的某基因表达量做T检验
685 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询?有没有网站进行过总结?
641 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
推荐内容
问
limma中的Removing heteroscedascity from count data和拟合线性模型是什么意思?
370 浏览
1 关注
0 回答
0 评论
All Rights Reserved Powered BY
WeCenter V4.1.0
© 2024
关于我们
社区规范
你的浏览器版本过低,可能导致网站部分内容不能正常使用!
为了能正常使用网站功能,请使用以下浏览器
Chrome
Firefox
Safari
IE 10+