computeMatrix画图问题 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

1: 关注

1102: 浏览

computeMatrix画图问题

孟老师好，经常在文献中看用computeMatrix画的热图中会有unique peaks,common peaks的展示，并对这些peaks进行注释，见附件Fig5G,H,Iscience.ade0027-1.pdf (632.39 K)。我的思路是，做3个分别是Unique,common peaks的bed输入文件，用computeMatrix的-R参数导入，但是我没有找到参考的代码，有点吃不准，想问问是不是应该这样操作，谢谢。

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 2 个回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2023-06-25 16:13

G图可以，但是H，和I图明显是富集分析的结果。

应该是找到peak以后又和gene做了关联，然后做了gene的富集分析。

赞同 0 0评论

关于作者

: lyx_2023 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

0: 回答

0: 文章

1: 问题

问题动态

发布时间: 2023-06-23 12:50

更新时间: 2023-06-25 16:13

关注人数: 1 人关注

相关问题

关于Cytoscape插件ClueGO的问题: 850 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

seqtk的使用技巧，可以处理那些序列问题？: 871 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

cox单因素分析问题: 762 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

bcl2fastq2安装问题: 1165 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

关于cox回归分析问题: 404 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

bash命令，遍历并区分“目录/文件”的问题: 1073 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

linux系统下，R语言，安装软件包install.packages("units")，出现如下问题该如何解决？: 1134 浏览 3 关注 3 回答 0 评论

基因组组装问题: 1236 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

关于生存分析的问题: 541 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

bioconductor的问题: 1008 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问生存分析KM-plot问题: 1021 浏览 1 关注 2 回答 0 评论

问尿代谢组正负离子数据标准化是否可以均用正离子检测出来的肌酐峰: 783 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 DiffBind 标准化数据: 521 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 GAPIT包导出的GWAS结果如何添加新的阈值线？以及GAPIT的结果文件中的nobs、H&B.P.Value、Effect分别是什么意思？: 1202 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问安装R包sf报错: 1288 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 kraken2软件运行时内存分配的问题: 1562 浏览 1 关注 2 回答 0 评论

问 logistic回归、异常值: 873 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问纤维二糖功能: 1334 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 sc-ATAC数据质控: 1133 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？: 815 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024