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关于cufflinks中cuffdiff的使用问题。

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如何提取比对上某一个基因或者某一段序列的所有reads

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怎么准确提取某一基因的ATG起始密码子位点

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使用tophat2和bowtie1寻找环形RNA时报错

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使用lapa进行APA分析

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trimmomatric使用报错

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使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。初始数据命名为pbmc

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使用fastp软件对fastq文件质控的问题

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问 RNA Seq中什么样的reads是chimeric reads？是不是多数的chimeric reads都是circRNA的？

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