在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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请问一下，我的噬菌体基因组fasta文件还是config打头的，是不是需要进一步拼接成scaffold？还是挑选最大的config进行后续分析？

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不同比对软件出的结果能进行比较吗？

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单细胞monocle3，路径很不对，有什么参数是值得调的吗

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为什么单端测序的数据解压会出现多个文件？

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在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下，如何利用cuffdiff进行差异基因分析。

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双端测序的sra文件，经过fastq-dump --split-3，出现3个结果是什么原因？如下图

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Closed Reference,Open Reference,Denovo聚类分析的联系和区别？

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关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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不同种群的the overall synonymous diversity (πS)是什么意思

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问 请问无参转录组的GO分析如何进行

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问 转录组数据样本聚类结果不理想

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问 使用tophat2和bowtie1寻找环形RNA时报错

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问 GO、KEGG分析中的showCategory是按照什么顺序来输出对应的条目的

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问 科研/读博

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问 Rstudio安装R包时，出现unable to move temporary installation

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问 ggplot绘图同时存在多个scale_fill_mamual

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问 利用GATK的HaplotypeCaller生成GVCF一直报错怎么回事

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问 为什么我在做go的时候，用clusterProfiler富集没有结果，但是用网站http://geneontology.org/ 做就有很多呢？代码如图

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问 使用cutadapt去掉adaptor后，fastqc结果的sequence distribution报错

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