FPKM计算问题

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如何利用利用TPM或者FPKM完成DESeq2完成的工作?

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RNA-seq，样本中存在同一基因对应不同的FPKM值

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RNA-seq count值和fpkm值不对应

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在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下，如何利用cuffdiff进行差异基因分析。

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问 请教一个问题，一个转录因子TF只会调控位于同一条链的基因，还是有可能调控反义链的基因？

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问 ciriRNA表达量如何计算？（更）

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问 二代转录组去除批次效应

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问 几个酶有许多共同基因，这些酶产物之间存在什么关系

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问 对突变组和对照组的某基因表达量做T检验

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问 ciriRNA表达量如何计算？

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问 WGCNA

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问 链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？

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问 log2(fold_change)可以用来做热图吗？遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时，怎么办？

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问 转录组和代谢组联合分析的方法有那些？

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