关于RSEM和RPKM

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在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下，如何利用cuffdiff进行差异基因分析。

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请问如何查询某基因的详细的Biological Function？

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怎么对基因启动子含有什么元件进行分析

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如何根据Datamonkey中FUBAR的结果计算该基因的dn/ds值

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使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。出现问题

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问一个关于miRNA ID的问题

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chipseq原始文件fastq如何截取DNA长度小于等于260bp进行后续mapping

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关于DESeq2样本聚类的问题

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