怎么寻找某个基因的不同可变剪切形式？ - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

4: 关注

975: 浏览

怎么寻找某个基因的不同可变剪切形式？

可变剪切

如题，想寻找EZH2这个基因在患者中的可变剪切形式和对应的表达丰度，不知道用什么软件怎么看呢

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 2 个回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-15 19:31

不同剪切形式，可以用UCSC genome browser去看，比如你说的这个gene [attach]220[/attach] 里面每一行就是1个转录本，就是不同的isoform。至于isoform的定量，现在都不准。你可以用cuffdiff或者stringtie那一套碰碰运气。

赞同 2 1评论

关于作者

: mrfoolish 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

0: 回答

0: 文章

2: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-14 11:55

更新时间: 2023-05-17 18:26

关注人数: 4 人关注

相关问题

基因组文件中chrUn具体是什么意思呢: 619 浏览 0 关注 0 回答 1 评论

生信问题（我也不知道该怎么问）: 1518 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，一个基因出现了两个不同的表达量数据，应该如何处理？: 636 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？: 848 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

seurat包，如何调节大热图左侧的基因字体大小: 1489 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

python怎么追加输出一列: 741 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

基因组组装问题: 1237 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

耐药细菌的比较基因组分析流程和机制探索: 590 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

oh my zsh怎么配置: 489 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

如何根据转录组数据得到新转录本？如何验证一个基因的多个转录本？: 1164 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问 rMATS是如何得到外显子的两种isform的？: 837 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024